Národní ústav veřejného zdraví již má v Evropě spolu s Velkou Británií, Dánskem a Islandem nejlepší schopnosti takzvaného sekvenování celého genomu. Sekvenování celého genomu se používá k monitorování pandemie a cílové analýzy v případech, které vyvolávají podezření na změny ve viru.
Něco přes 5 % vzorků ze všech případů infekce v Norsku je odesláno ke sledování do referenční laboratoře FHI. Doposud byla zcela genově sekvenována celkem asi 2 procenta pozitivních výsledků testů na koronavirus. V posledních týdnech se toto číslo zvýšilo na přibližně 3 procenta kvůli zvýšené poptávce a vývoji metod. Nyní bude tento podíl činit až 10 procent a dochází k posílení monitoringu.
Informace o cestování přes Švédsko do Polska
Analytické schopnosti a monitoring koronaviru posilují tři hlavní opatření.
FHI zvyšuje své vlastní analytické schopnosti a vede dialog o spolupráci s Norským sekvenačním centrem a OUS (Oslo universitetssykehus HF) na sekvenování celého genomu. Zavedení a škálování metody s cíleným rychlejším sekvenováním. FHI pracuje na zavedení screeningu na bázi PCR na anglickou variantu viru. Sekvenování celého genomu je časově náročné. Podle dosud používané metodiky trvá strojům minimálně 5–6 dní, než zkontrolují vzorky, kromě údajů před a po práci a analýzy.
. Změna metody testování
Minulý týden FHI vyvinula novou metodiku. Poskytuje rychlejší, cílené sekvenování určitých oblastí viru (včetně hledání anglické varianty viru), kdy vlastní analýza trvá 2-3 dny. Díky této metodě vnitřně více než ztrojnásobíme účinnost.
– Kromě toho zvážíme rychlé screeningové testy (PCR) k detekci koronaviru. Aby nemocniční laboratoře mohly přímo detekovat anglickou variantu viru. Doufáme, že doporučení metod budeme mít hotová do příštího týdne (4. týden), říká zástupkyně ředitele Gun Peggy Knudsen z FHI.
Posilujeme komunikaci s obcemi
O pozitivních zjištěních ohledně anglické varianty zatím SZÚ ihned informoval magistrát.
– Nyní budeme v úzkém dialogu s obcemi v zemi. Především proto, abychom zjistili, jak můžeme posílit komunikaci o všech typech výsledků testů, říká Knudsen
„Mimo jiné zvýšíme naši schopnost poskytovat obcím rychlejší zpětnou vazbu. Přednost budou mít ti, kteří poslali vzorky podezřelé z anglické varianty epidemie a kde se nic nenašlo,“ dodává.
testování, izolace, karanténa a sledování infekcí
– Chápeme, že v obcích panuje netrpělivost. Je však důležité mít na paměti, že právě zavedená opatření jsou nejúčinnější pro omezení šíření – testování, izolace, karanténa a sledování infekce. Sekvenování genomu je doplněk k získání vodítek o tom, jak se bude epidemie vyvíjet, říká Knudsen.
Analýzy probíhají. Přednost mají analýzy z ohnisek s podezřením na anglickou variantu
Minulý víkend 22-24 nám přišlo velké množství vzorků (cca 350). ledna z Nordre Follo, který je zmapován pro možnou souvislost s případy tam ověřené anglické varianty viru. Analýzy probíhají a odpovědi se očekávají v pondělí 25. ledna a průběžně po několik dalších dní.
Źródło: fhi.no