Kansallisella kansanterveyslaitoksella on jo nyt Euroopan parhaat ns. koko genomin sekvensointimahdollisuudet yhdessä Iso-Britannian, Tanskan ja Islannin kanssa. Koko genomin sekvensointia käytetään pandemia- ja kohdeanalyysin seurantaan tapauksissa, joissa epäillään viruksen muutoksia.
Hieman yli 5 % kaikista Norjan tartuntatapauksista näytteistä lähetetään FHI:n vertailulaboratorioon tarkkailuun. Tähän mennessä yhteensä noin 2 prosenttia positiivisista koronavirustestituloksista on täysin geenisekvensoitu. Viime viikkoina tämä luku on noussut noin 3 prosenttiin lisääntyneen kysynnän ja menetelmien kehityksen vuoksi. Nyt tämä osuus nousee 10 prosenttiin, ja seurantaa tehostetaan.
Tietoja matkustamisesta Ruotsin kautta Puolaan
Koronaviruksen analyyttisiä valmiuksia ja seurantaa vahvistetaan kolmella päätoimenpiteellä.
FHI lisää omaa analyyttistä kykyään ja käy vuoropuhelua yhteistyöstä Norjan sekvensointikeskuksen ja OUS:n (Oslo universitetssykehus HF) kanssa koko genomin sekvensoinnista. Menetelmän esittely ja skaalaus kohdistetulla nopeammalla sekvensoinnilla. FHI pyrkii ottamaan käyttöön PCR-pohjaisen seulonnan viruksen englanninkieliselle variantille. Koko genomin sekvensointi on aikaa vievää. Tähän mennessä käytetyn metodologian mukaan näytteiden tarkastaminen koneilla kestää vähintään 5-6 päivää työskentelyn edeltävän ja jälkeisen tiedon ja analyysien lisäksi.
. Testausmenetelmän muuttaminen
Viime viikolla FHI kehitti uuden menetelmän. Se tarjoaa nopeamman ja kohdistetun viruksen tiettyjen alueiden sekvensoinnin (mukaan lukien viruksen englanninkielisen muunnelman etsiminen), jossa varsinainen analyysi kestää 2-3 päivää. Tämän menetelmän ansiosta sisäinen tehokkuus yli kolminkertaistuu.
– Lisäksi harkitsemme pikaseulontatestejä (PCR) koronaviruksen havaitsemiseksi. Jotta sairaaloiden laboratoriot voivat havaita suoraan viruksen englanninkielisen muunnelman. Toivomme, että menetelmäsuositukset ovat valmiina ensi viikolla (viikko 4), sanoo Gun apulaisjohtaja Peggy Knudsen FHI:stä.
Vahvistamme kommunikaatiota kuntien kanssa
Toistaiseksi NIPH on välittömästi ilmoittanut kunnalle myönteisistä löydöistä englanninkielisestä variantista.
– Käymme nyt tiiviissä vuoropuhelussa maan kuntien kanssa. Ensisijaisesti selvittääksemme, kuinka voimme vahvistaa viestintää kaikentyyppisistä testituloksista, Knudsen sanoo
– Lisäämme muun muassa kykyämme antaa kunnille nopeampaa palautetta. Etusija annetaan niille, jotka lähettivät näytteitä, joiden epäillään olevan epidemian englanninkielinen muunnos ja joista ei löytynyt mitään", hän lisää.
Testaus, eristäminen, karanteeni ja tartuntojen seuranta
– Ymmärrämme, että kunnissa on kärsimättömyyttä. Tärkeää on kuitenkin muistaa, että leviämistä rajoittavat tehokkaimmat toimenpiteet ovat vakiintuneet - testaus, eristäminen, karanteeni ja tartuntojen jäljitys. Genomisekvensointi on lisäys vihjeiden saamiseksi epidemian kehittymisestä, Knudsen sanoo.
Analyysit ovat käynnissä. Etusijalla ovat analyysit epidemioista, joissa on epäilty englantilainen variantti
Viime viikonloppuna 22-24 saimme suuren määrän näytteitä (n. 350). tammikuuta Nordre Follosta, joka on kartoitettu mahdollisesta yhteydestä siellä varmennettuihin viruksen englanninkielisen muunnelman tapauksiin. Analyysit jatkuvat ja vastauksia odotetaan maanantaina 25. tammikuuta ja jatkuvasti useiden seuraavien päivien ajan.
Lähde: fhi.no