Національний інститут громадського здоров’я вже має найкращі можливості для так званого секвенування цілого геному в Європі, а також у Великобританії, Данії та Ісландії. Секвенування всього геному використовується для моніторингу пандемії та цілеспрямованого аналізу при підозрі на зміни вірусу.
Трохи більше 5% зразків від усього забруднення в Норвегії контролюються референс-лабораторією FHI. На сьогоднішній день загалом близько 2 відсотків позитивних результатів тесту на коронавірус повністю секвенували гени. За останні тижні ця цифра зросла приблизно до 3 відсотків через збільшення попиту та розробки методів. Зараз ця частка становитиме до 10 відсотків і моніторинг посилюється.
Інформація про подорож через Швецію до Польщі
Аналітичний потенціал та моніторинг коронавірусу посилюються трьома основними заходами.
FHI нарощує власні аналітичні можливості та веде діалог щодо співпраці з Норвезьким центром секвенування та OUS (Oslo universitetssykehus HF) у сфері секвенування всього геному. Запровадити та розширити метод за допомогою цільового швидшого секвенування. FHI працює над впровадженням скринінгового тесту на основі ПЛР на англійський варіант вірусу. Секвенування всього геному займає багато часу. Згідно з методологією, яка використовується дотепер, на перевірку зразків за допомогою машин потрібно не менше 5-6 днів, на додаток до даних і аналізів до та після роботи.
. Зміна методу тестування
Минулого тижня FHI розробила нову методологію. Він забезпечує більш швидке та цілеспрямоване визначення послідовності певних областей вірусу (наприклад, для пошуку англійського варіанту вірусу), де фактичний аналіз займає 2-3 дні. Завдяки цьому методу ми внутрішньо підвищуємо ефективність більш ніж у три рази.
– Крім того, ми розглянемо швидкі скринінг-тести (ПЛР) для виявлення коронавірусу. Щоб лікарняні лабораторії могли безпосередньо виявити англійський варіант вірусу. Ми сподіваємося, що наступного тижня (4-го тижня) наші рекомендації щодо методу будуть опубліковані», — каже заступник директора Gun Пеггі Кнудсен з FHI.
Ми посилюємо комунікацію з муніципалітетами
Наразі NIPH негайно поінформував муніципалітет про позитивні висновки щодо англійського варіанту.
– Зараз ми будемо вести тісний діалог з комунами країни. Перш за все, щоб з’ясувати, як ми можемо посилити комунікацію про всі типи результатів тестів, каже Кнудсен
«З-поміж іншого, ми розширимо нашу здатність швидше надавати зворотний зв’язок муніципалітетам. У пріоритеті ті, хто надсилав зразки, підозрювали в англійському варіанті епідемії і де нічого не виявили», – додає він.
тестування, ізоляція, карантин і відстеження інфекцій
– Ми розуміємо, що в муніципалітетах є нетерпіння. Однак важливо пам’ятати, що найефективніші для обмеження поширення встановлені заходи – тестування, ізоляція, карантин та відстеження інфекцій. Секвенування геному — це доповнення, яке дає вам підказки щодо того, як розвиватиметься епідемія, каже Кнудсен.
Тривають аналізи. Пріоритет надається аналізу спалаху з підозрою на англійський варіант
Минулими вихідними, 22-24, ми отримали велику кількість зразків (бл. 350). Січень від Nordre Follo, який нанесено на карту для можливого підключення до випробуваних там випадків англійського варіанту вірусу. Аналіз триває, а відповіді очікуються з понеділка, 25 січня, і безперервно протягом наступних кількох днів.
Źródło: fhi.no
