National Institute of Public Health har allerede den beste kapasiteten for såkalt hele genom-sekvensering i Europa, sammen med Storbritannia, Danmark og Island. Hele genom -sekvensering brukes til pandemisk overvåking og målrettet analyse der det er mistanke om endringer i viruset.
Litt mer enn 5% av prøvene fra all forurensning i Norge overvåkes av FHIs referanselaboratorium. Til dags dato har totalt om lag 2 prosent av de positive koronavirustestresultatene blitt fullstendig gensekvensert. De siste ukene har dette tallet steget til rundt 3 prosent på grunn av økt etterspørsel og metodeutvikling. Nå vil denne andelen være opp til 10 prosent og overvåking styrkes.
Informasjon om reiser gjennom Sverige til Polen
Den analytiske kapasiteten og overvåking av koronaviruset styrkes med tre hovedtiltak.
FHI øker sin egen analytiske kapasitet og er i dialog om samarbeid med Norwegian Sequencing Center og OUS (Oslo universitetssykehus HF) om hele genom -sekvensering. Introduser og skaler opp metoden med målrettet raskere sekvensering. FHI jobber med å introdusere en PCR-basert screeningtest for den engelske varianten av viruset. Hele genom -sekvensering er tidkrevende. I henhold til metodikken som er brukt så langt, tar det minst 5-6 dager før prøvene blir kontrollert av maskiner, i tillegg til data før og etter arbeidet og analyser.
. Endring av testmetode
I forrige uke utviklet FHI en ny metodikk. Det sikrer raskere, målrettet sekvensering av visse områder av viruset (blant annet for å lete etter en engelsk variant av viruset), hvor den faktiske analysen tar 2-3 dager. Takket være denne metoden øker vi effektiviteten med mer enn tre ganger internt.
- I tillegg vil vi vurdere hurtige screeningtester (PCR) for å oppdage koronaviruset. Slik at sykehuslaboratorier kan oppdage den engelske varianten av viruset direkte. Vi håper å ha våre metodeanbefalinger på plass neste uke (uke 4), sier Gun -visedirektør Peggy Knudsen i FHI.
Vi styrker kommunikasjonen med kommunene
Så langt har FHI umiddelbart informert kommunen om de positive funnene angående den engelske varianten.
- Vi skal nå være i tett dialog med kommunene i landet. Primært for å finne ut hvordan vi kan styrke kommunikasjonen om alle typer testresultater, sier Knudsen
- Blant annet vil vi øke vår evne til å levere tilbakemeldinger raskere til kommunene. Prioritet ble gitt til de som sendte prøver som var mistenkt for den engelske varianten av epidemien og hvor ingenting ble funnet ”- legger han til.
Testing, isolasjon, karantene og spore infeksjoner
- Vi forstår at det er utålmodighet i kommunene. Imidlertid er det viktig å huske at etablerte tiltak er mest effektive for å begrense spredningen - testing, isolering, karantene og sporing av infeksjoner. Genom -sekvensering er et tillegg for å gi deg ledetråder om hvordan epidemien vil utvikle seg, sier Knudsen.
Analyser pågår. Utbruddsanalyser med mistenkt engelsk variant prioriteres
Forrige helg, 22-24, mottok vi et stort antall prøver (ca. 350). Januar fra Nordre Follo, som er kartlagt for en mulig forbindelse til de engelske virusvarianttilfellene som ble testet der. Analyser pågår og svar forventes fra mandag 25. januar og fortløpende de neste dagene.
Źródło: fhi.no
